index - Microbial Genome Annotation & Analysis Platform (MAGE) Accéder directement au contenu

Bienvenue sur la collection MicroScope, vous y trouverez les publications scientifiques qui ont utilisé la plate-forme MicroScope

MicroScope membre des infrastructures IFB et France Génomique est la plate-forme d'annotation et d'analyse du génome microbien du LABGeM - CEA/Genoscope sous la tutelle CEA, CNRS et Université Evry Val de Seine

Les différentes activités de la plate-forme MicroScope sont : L'innovation de génomes microbiens (génomes et métagénomes assemblés) et développement d'outils destinés à l'annotation, à la génomique et au métabolisme comparatifs de génomes bactériens; la génomique comparative et pangénomique; la prédiction de fonction et de processus biologiques; la reconstruction de réseaux métaboliques; l'analyse de données de transcriptonique; l'assistance techniques; la formation à l'annotation de génomes procaryotes et à la curation de réseaux métaboliques.

COLLABORATION INTERNATIONALE

 

 Pour toute question : hal@cea.fr

 

NOMBRE DE TEXTES INTEGRAUX

271

NOMBRE DE NOTICES

103

INDICATEUR D'OPEN ACCESS

87 %

MOTS CLES

Genome evolution Mineral weathering Proteomics CTX-M-15 Crystallography Pangenome Metagenomics Genome Coevolution Continuous culture Flavobacterium psychrophilum Magnetotactic bacteria Horizontal gene transfer Oxidative stress Comparative genomics Diversity Insect Brochothrix thermosphacta Bacteriocin Archaea Alkaline thermal spring Bacterial FAMILY Plasmid Dehalogenation Gut microbiota Bioassays Acinetobacter baumannii Directed evolution Dichloromethane Clostridioides difficile Xenorhabdus Vibrio tapetis Metabolomics DDDH Acidithiobacillus ferrooxidans Rhizobium Bactérie Symbiosis ACL Lactic acid bacteria Rhizobia Heavy metal resistance ESBL Biofilm Microbiology Actinorhizal symbiosis Adaptation Activated sludge Comparative genomic analysis Pseudomonas aeruginosa Aquaculture Pathogenicity Genome sequence DNA Food Metabolism Thermophile Acyl homoserine lactone Arsenic Digital DNA-DNA hybridization Antibiotic resistance Average nucleotide identity Virulence Bacteroidetes Complete genome Escherichia coli Anaerobic Functional genomics Genomes Bacterium Thermococcus Nitrogen fixation Acid mine drainage AMD Cyanobacteria Transcriptomics Fish pathogens Entomopathogenic bacteria Acid stress Bioremediation Virulence factors Aphids Betaproteobacteria Phylogeny Ralstonia solanacearum Bactérie entomopathogène Experimental evolution Bacteriophage Mobile genetic elements Fish pathogen Clostridium difficile Evolution Transcriptome Polyphasic taxonomy Agrobacterium tumefaciens Secondary metabolites Genomics Biodiversity Bacteria Bacterial genetics